Este trabajo presenta un análisis de los programas de maestría ofrecidos por las facultades de ingeniería de ACOFI, enfocándose en la distribución por modalidad, por número de créditos, su distribución en el territorio nacional y diferentes enfoques sobre la incorporación de la investigación en los currículos. Ante la diversidad de propuestas, lo que se discutirá en profundidad en el artículo completo, como punto de partida se presenta la propuesta de Maestría de Investigación concebida a través de una reflexión del grupo de investigación Ciencia e Ingeniería del Agua y el ambiente que dio como resultado la actual estructura y funcionamiento de la Maestría en Hidrosistemas de la Pontificia Universidad Javeriana. Esto tiene como finalidad iniciar la reflexión y posterior debate de lo que son, lo que deberían ser y lo que queremos que sean las maestrías de Investigación en las facultades de ingeniería del país.