El reto de estudiantes y docentes de los programas de Ingeniería en las asignaturas de   Química Orgánica y Bioquímica es obtener  a través de procesos de enseñanza aprendizaje innovadores,  la percepción real de las moléculas y de las reacciones químicas en las que intervienen;  dado que los compuestos orgánicos naturales y sintéticos son millones, se requiere de una metodología que permita entender la importancia del átomo de carbono, la nomenclatura de los compuestos orgánicos y su aplicación bioquímica; en un ambiente donde se construya el saber, se descubran nuevas habilidades; se aprovechen las nuevas tecnologías de la información y comunicación (Moodle), los modelos moleculares a escala, y los diversos software libres de modelamiento molecular. Se   hace entonces necesario repensar las nuevas estrategias metodológicas y didácticas del aprendizaje para integrar el conocimiento de una forma vivencial y mucho más próxima a los jóvenes estudiantes, que son nativos virtuales y que tiene un acceso permanente a una amplia información pero que difícilmente logran filtrar dicho contenido, interiorizarlo, aplicarlo y hacerlo significativo (conocimiento).

Esta estrategia aplicada en los procesos de enseñanza aprendizaje con el manejo de los software libres permite a los estudiantes asimilar en los procesos bioquímicos las estructuras de proteínas, aminoácidos, ácidos nucleicos, carbohidratos y lípidos, comprendiendo los contenidos  de las páginas y el uso en espacios como biotecnología, análisis de alimentos entre otros, en este caso al ingresar a http://mm.rcsb.org/, se ofrece las estructuras en forma 3D de la base de datos de Protein Data Bank; por mencionar uno de los muchos casos de aplicación.

El trabajo realizado durante dos semestres inicialmente en química orgánica (2014-II  y en Bioquímica (2015 I), ha permitido reportar alcances y conclusiones tales como:

• Nuevas formas de expresar los procesos químicos involucrando nuevas tecnologías en el desarrollo académico, captando la atención y la motivación de los estudiantes hacia los nuevos temas de elevado interés académico para su carrera y futuro profesional, que vistos de otra manera y por experiencias anteriores no habrían sido tan fáciles de abordar y conceptualizar, además   de contar con alto porcentaje de recordación.
• Nueva manera de adquirir y ampliar   los conocimientos, a través del uso permanente de las TIC en el aula, como lo son: presentaciones en prezi y power point, análisis de videos en clase, simulaciones de laboratorio que facilitan enormemente el desarrollo de habilidades de observación cualitativa y cuantitativas, creación de hipótesis y comprobación o rechazo de las mismas a través del uso de la metodología científica.
• El promedio de la nota del grupo aumentó cuando fueron usadas estas estrategias dado que paso de 3,8 a 4,1, para tener un promedio final de 3,9.
• El comité curricular de la Facultad ha considerado esta metodología como un proceso de Innovación, que aporta al proceso formativo de los estudiantes.